在使用顯微鏡時首先應該考慮的是你需要觀察什么內容，希望得到什么觀察/拍攝效果，然后才能決定采用什么類型的顯微鏡。如果想達到最理想的明視野顯微鏡的效果指顯微鏡應達到的最佳分辨率)而顯微鏡上用的卻是消色差或相差物鏡，或所使用的聚光器的數值孔徑只有1.2(阿貝聚光器)那么無論怎樣努力，也不可能拍出最好的照片(指用油鏡工作時)。

所以，拍攝前應檢查確定所使用的顯微鏡類型及組件是否匹配，調整方法是否正確，這是至關重要的，一般來講，確定所使用的顯微鏡方法是否正確，應先看物鏡的類型，再查聚光器用的是否正確，然后再核實是否符合柯勒照明條件。